Normalmente se utilizan muchos métodos para estudiar el mecanismo de acción purificados. El conocimiento de la estructura tridimensional de la proteína proporciona información importante. El valor de la información estructural aumenta en gran manera con la química de proteínas clásica y con los modernos métodos de la mutagènesis dirigida, que permiten a los enzimòlogos examinar el papel de aminoácidos concretos en la estructura y en la reacción del enzima. No obstante, el enfoque central para estudiar el mecanismo de una reacción catalizada por un enzima consiste en medir la velocidad de la reacción y la forma en que se modifica como respuesta a cambios en los parámetros experimentales. disciplina que se conoce como cinética enzimática. Es este el método mas antiguo para conocer el mecanismo enzimático y uno de los que continúan siendo mas importantes en la actualidad.
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